商标使用许可合同备案制度是一个法律术语，是指：根据《商标法》第40条第3款规定，签订商标使用许可合同后应当在法定期限内向商标局备案。商标局在《商标公告》上刊登商标使用许可合同备案公告。
注意事项：  
1、许可人必须是注册商标所有人或者是经注册商标所有人授权的许可人，被许可人可以是自然人、法人或其他组织。
2、商标使用许可合同备案手续由许可人办理。
3、通过一份合同许可一个被许可人使用多个商标的，许可人应当按照商标的数量报送《商标使用许可合同备案申请书》，但可以只报一份商标使用许可合同副本，其他申请提交合同复印件，并指明合同原件所在。
4、通过一份合同许可多个被许可人使用一个商标的，许可人应当按照被许可人的数量报送《商标使用许可合同备案申请书》，但可以只报一份商标使用许可合同副本。
5、商标注册人可以在许可合同中授权被许可人将商标再许可给第三方使用，也可以出具相应的授权书，授权被许可人将商标再许可给第三方使用。被许可人再许可第三方使用注册商标的，应提交其与原许可人签订的含有允许其许可第三方使用内容的合同原件或者由原许可人出具相应的授权书。上述合同或授权书已在商标局备案的，许可人办理新的再许可备案时，仍应提交上述合同副本或授权书的原件或经公证的复印件。属于多重再许可的，许可人办理再许可备案时，应提交该商标从第一次许可使用到本次许可使用的合同副本、授权书原件或经公证的复印件。
6、商标转让申请未经商标局核准时，不能以受让人名义办理商标使用许可合同备案。
7、对不符合要求的商标使用许可合同备案申请，商标局不予受理或者通知许可人予以补正。许可人应自收到通知之日起1个月内，按照商标局指定的内容补正后连同补正通知书一并通过邮寄或者直接交送商标局。
8、依法订立的商标使用许可合同一旦按照约定时间和条件生效，即对合同当事人具有法律约束力。商标使用许可合同是否备案，对合同本身法律效力并无影响。但是，如果合同当事人在订立商标使用许可合同时，明确约定把商标使用许可合同经商标局备案作为合同生效的条件。
9、商标使用许可合同提前终止的，许可人和被许可人应在双方签订终止协议或法院及仲裁机关做出终止决定之日起3个月内，由许可人报送商标局备案。
10、商标使用许可合同备案公告刊登在每月出版的第2期《商标公告》上，主要刊登内容为：商标注册号、商标、许可人与被许可人名义、许可使用商品、许可使用期限等。
11、商标使用许可合同备案手续是通过商标代理机构办理的，商标局将有关书件寄交给商标代理机构。
12、办理商标使用许可合同备案变更申请时，应提交企业登记机关出具的变更证明文件。