商标指定颜色申请指的是，申报时候按照客户设计好的彩色样稿来递交。通常经过设计师设计好的商标logo是带有颜色的。如果按照指定的颜色来申报，将来商标注册取得专用权，使用的时候也要按照指定的颜色来使用，不得任意更改。
黑白申请即不指定颜色申请，是指申报时候按照黑白墨稿来递交申请。    在商标代理实务中，黑白申请的商标将来商标取得专用权，可以任意套用颜色来使用。这一点要比指定颜色申请更加宽泛，一般专业建议黑白申请。